آیت‌الله العظمی نوری همدانی با اشاره به موضوع استقلال حوزه‌ها اظهار داشتند: «مراد ما از استقلال حوزه عدم وابستگی به دولت‌ها است، حوزه وابسته به هیچ دولتی در هیچ زمانی نباید باشد و اگر وابسته شد، دیگر نمی تواند تذکر دهد، علما و حوزه‌های علمیه همیشه زبان و مدافع ارزش‌های اسلامی و انقلابی و مردم بودند و این وضعیت الحمدلله در حوزه‌ها برقرار است، خصوصا طلاب جوان بسیار با انگیزه و با هوشیاری از این نظام و انقلاب دفاع و حمایت می‌کنند.»
ایشان تاکید کردند: «اعتقاد ما این است که این نظام مبتنی بر اسلام و اهل بیت(ع) و ولایت فقیه، کار آمد ترین و جامع ترین نظام برای اداره یک کشور است و در طی این سی و هشت سال به خوبی نشان داده است، البته ما به کمبود‌ها و مشکلات واقف هستیم که دولت‌ها باید برای برطرف کردن آن تلاش کنند تا مردم از حیث اقتصادی هم توانمند باشند.» (خ-۱۳۲۶)
