آیت‌الله محمد یزدی که در حال حاضر ریاست شورای عالی جامعه مدرسین حوزه علمیه قم را بر عهده دارد در انتخابات مجلس خبرگان رهبری که در صبح روز سه شنبه مورخ ۱۳۹۳/۱۲/۱۹ برگزاری گردید با کسب ۴۷ رای به عنوان ریاست هفدهمین دوره مجلس خبرگان رهبری نیز انتخاب شد.
کاندیداهای ریاست مجلس خبرگان رهبری در این دوره آیت‌الله محمد مومن، آیت‌الله سید محمود هاشمی شاهرودی، آیت‌الله علی اکبر هاشمی رفسنجانی و آیت‌الله محمد یزدی بودند که حضرت آیت الله هاشمی شاهرودی قبل از شروع انتخابات انصراف خود را اعلام نمودند، و در نهایت حضرت آیت الله محمد یزدی با کسب ۴۷ رای از مجموع ۷۳ رای مأخوذه بعنوان ریاست جدید مجلس خبرگان رهبری انتخاب شدند.
همچنین در جلسه بعدازظهر سه شنبه با رای اعضای مجلس خبرگان حضرت آیت الله سیدمحمود هاشمی شاهرودی با ۴۲ رأی و آیت الله محمدعلی موحدی کرمانی با ۲۹ رأی به ترتیب به عنوان نائب رئیس اول و نائب رئیس دوم و آیت الله دری نجف آبادی با ۴۵ رأی و آیت الله سیداحمد خاتمی با ۳۴ رأی به عنوان منشیان هیأت رئیسه انتخاب شدند.
