آیت‌الله خاتمی توجه ویژه رهبر معظم انقلاب اسلامی به آیت‌الله مصباح یزدی را نشان از الگو بودن آن مرحوم دانستند و اظهار کردند: آیت‌الله مصباح یزدی عالمی در تراز انقلاب اسلامی بود و کسی‌که به دنبال عالم بودن است باید از این شخصیت الگوبرداری کند. نائب رئیس جامعه مدرسین تصریح کردند: بعد از انقلاب تحریف‌گران با دروغ و تهمت شخصیت آیت‌الله مصباح یزدی را به صورت دیگری به نمایش گذاشتند به صورتی که این شخص نقشی در مبارزات انقلابی نداشته است. آیت‌الله خاتمی با اشاره به اینکه آیت‌الله مصباح یزدی در برابر استحاله‌های فکری ایستاد و هزینه آن که هتک حرمت و اهانت بود را پذیرفت، اظهار کردند: افرادی که هیچ تقوایی نداشتند هر چه ناجوانمردی داشتند را نثار آیت‌الله مصباح یزدی کردند. لازم نیست ترکش گلوله به انسان برخورد کند تا انسان جانباز و رزمنده شود، این ترکش‌ها و ناجوانمردی‌ها سخت‌تر است. عضو شورای عالی حوزه‌های علمیه با بیان اینکه بنده نسبت به آیت‌الله مصباح یزدی به عنوان فقیه، فیلسوف، متفکر و صاحب نظر در مسائل اسلام ارادت ویژه دارم، عنوان کردند: این شخصیت خلاء امثال شهید مطهری را پر کرد.(خ ۱۴۰۵)
