آیت‌الله العظمی شبیری زنجانی با تأکید بر تقویت دروس اخلاق در حوزه‌های علمیه گفتند: «امام راحل که درس اخلاق می‌گفتند تا چند روزی حوزه یک حال و هوای دیگر داشت. امروز جای این درس اخلاق‌ها در حوزه خالی است».
ایشان در دیدار آیت‌الله حسینی بوشهری دبیر شورای عالی حوزه‌های علمیه، شرایط کنونی ایران و جهان را شرایطی ویژه دانستند و بر لزوم تقویت و گسترش درس‌های اخلاق در حوزه علمیه تاکید کردند.
استاد حوزه علمیه قم در ادامه نپرداختن به سیره حضرات معصومین(ع) و علمای شیعه را یکی از دلایل کم رنگ شدن مباحث اخلاقی دانستند و گفتند: باید برای طلبه‌ها مجلسی تشکیل شود و سخنرانان با استناد به روایت‌های نورانی و سیره بزرگان مباحث اخلاقی را شرح دهند. (خ-۱۳۶۵)
