آیت الله العظمی مکارم شیرازی نسبت به تبعات اجرای حکم اعدام شیخ آیت الله نمر هشدار دادند و تاکید کردند: آل سعود فکر نکند با این اقدام شیعیان می‌ترسند، بلکه در مقابل قوی تر و شجاع تر خواهند شد.
این مرجع تقلید یادآورشدند: شیخ نمر درباره احقاق حقوق مردم صحبت کرده و هیچ جرمی مرتکب نشده است؛ ایشان فردی نترس و شجاع است، کدامیک از موازین اسلامی اجازه می‌دهد چنین آدمی را حکم اعدام برایش صادر کنند؟
ایشان خطاب به مقامات سعودی خاطرنشان کردند: بدانید اگر این حکم اجرا شود آثار سویی برای شما خواهد داشت و تمام شیعیان دنیا کینه و بغض شدیدی نسبت به همه شما پیدا خواهند کرد. (خ-۱۲۵۵)
